Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colca2F8VPY8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colca2F8VPY8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms