Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zc3h7bF8VPP8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h7bF8VPP8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms