Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
D430041D05RikF6ZGR6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms