Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC067074F6RXI4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC067074F6RXI4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC067074F6RXI4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms