Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herc6F2Z461 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms