Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss56F2YMG0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss56F2YMG0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms