Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod3E9QA62 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod3E9QA62 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod3E9QA62 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod3E9QA62 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod3E9QA62 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod3E9QA62 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod3E9QA62 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lmod3E9QA62 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Lmod3E9QA62 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmod3E9QA62 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms