Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms