Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms