Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrdnE9Q9K5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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