Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms