Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Urb2E9Q7L1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms