Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DspE9Q557 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DspE9Q557 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms