Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms