Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r238E9Q373 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms