Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2A2

Gm38392, Predicted gene, 38392 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm38392E9Q2A2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm38392E9Q2A2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm38392E9Q2A2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm38392E9Q2A2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms