Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fndc1E9Q043 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms