Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms