Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd2E9PZM4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms