Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Pcdh10E9PXQ7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcdh10E9PXQ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms