Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp54bE9PXC0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms