Protein–RNA interactions for Protein: E9PWK2

Vmn1r224, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r224E9PWK2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r224E9PWK2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r224E9PWK2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms