Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930407I10RikD3Z5T8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms