Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms