Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nxpe3B9EKK6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms