Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms