Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cttnbp2B9EJA2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms