Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm20547B8JJN0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gm20547B8JJN0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Gm20547B8JJN0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Gm20547B8JJN0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Gm20547B8JJN0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Gm20547B8JJN0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Gm20547B8JJN0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20547B8JJN0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20547B8JJN0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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