Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam71aB7XG49 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71aB7XG49 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms