Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc11B2RXC1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms