Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26c1B2RXA7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26c1B2RXA7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26c1B2RXA7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26c1B2RXA7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26c1B2RXA7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26c1B2RXA7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26c1B2RXA7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26c1B2RXA7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26c1B2RXA7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms