Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms