Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd34aB2RW11 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ankrd34aB2RW11 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms