Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms