Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CadB2RQC6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CadB2RQC6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CadB2RQC6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CadB2RQC6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CadB2RQC6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CadB2RQC6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CadB2RQC6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CadB2RQC6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CadB2RQC6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CadB2RQC6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CadB2RQC6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CadB2RQC6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms