Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spocd1B1ASB6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms