Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox1B1APN4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox1B1APN4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms