Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms