Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Gm6880A3KG45 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6880A3KG45 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms