Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htra4A2RT60 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms