Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upf2A2AT37 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms