Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef17A2ASJ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms