Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn3aA2ASI5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms