Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtf1A2AQ19 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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