Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tubb1A2AQ07 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms