Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms