Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FocadA2AKG8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms