Protein–RNA interactions for Protein: A2AKE5

1700003F12Rik, RIKEN cDNA 1700003F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003F12RikA2AKE5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
1700003F12RikA2AKE5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700003F12RikA2AKE5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms