Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lcn6A2AJB9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Lcn6A2AJB9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Lcn6A2AJB9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Lcn6A2AJB9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn6A2AJB9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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