Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdccag3A2AIW0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdccag3A2AIW0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms